如果船员申请证书后来不及领取纸质证书，在大多数情况下是可以上船任职的。因为现在船员电子证书与纸质证书具有同等效力。船员可以通过以下三种方式查看自己的电子证照：

1. 登录海事 “一网通办” 平台：通过电脑登录（https://zwfw.msa.gov.cn）平台，进入用户中心 “我的证照” 栏目查看；

2. 使用微信小程序：搜索海事 “一网通办” 小程序，用海事 “一网通办” 账户登录后，进入用户中心 “我的证照” 栏目查看；

3. 下载 “海事通” app：在该应用程序的我的证照栏可查看并保存电子证照。

不过，具体的规定可能因地区、船舶类型、航运公司要求等因素而有所不同。建议船员在遇到这种情况时，提前与所在的航运公司以及相关海事管理部门进行沟通确认，以确保能够顺利上船任职。