船员健康证到期后，需要根据不同的情况进行处理：
船舶在航行中到期：
在到达下一个有《1978 年海员培训、发证和值班标准国际公约》缔约国认可的主检医师的停靠港之前，该健康证仍然有效，但有效期不得超过 3 个月。
在紧急情况下，海事管理机构可允许持有近日过期的健康证书的海船船员工作至下一个具有缔约国认可从业医生的港口，许可的期限同样不得超过 3 个月。
船舶在非航行中到期：船员不能在船上继续工作，应尽快重新申请办理健康证。
重新办理健康证的具体步骤如下：
选择体检机构：到具备船员体检资质的医院进行体检。具有资质的体检机构可以在中华人民共和国海事局网站在线查询模块上查询，也可以通过拨打所在地海事管理机构船员管理部门电话进行查询。
信息采集：船员到医院体检前需要完成信息采集，通常需携带二寸白底彩色证件近照和本人身份证。
进行体检：空腹到指定的体检机构接受体检，体检项目需符合《船员健康检查要求》（GB30035-2021）的标准。
领取健康证：完成体检后，若满足相关要求（如年满 18 周岁、持有有效的身份证件、符合体检标准、完成海船船员信息采集等），由主检医师在健康证明上签名，并加盖体检机构公章，船员即可领取新的健康证。
