海员合格证更新后，一般情况下，如果是正常的更新换证流程且各项手续和培训考核都顺利完成，通常在 15 个工作日左右可以换出新证。但具体时间可能会因地区、海事部门工作效率以及申请换证的人数等因素而有所不同。

按照规定，海员合格证有效期为 5 年。在证书到期前参加规定的知识更新培训并通过考核，即可申请换证。如果是在到期后换证，过期不超过 1 年的，参加知识更新培训成绩合格后可以申请换证；过期 1 年以上的则需要重新培训并通过考核才能换证。有些地区可能会有一站式的换证服务，能加快换证速度，比如有试点班可以做到入学、考试、换证全流程 3 天搞定。