航海院校轮机管理毕业是否能直接报名考三管轮，取决于多种因素。具体如下：

1. 毕业时间在 5 年内且在校期间未申请过初次适任考试：这种情况下可凭毕业证书向任何具有相应考试权限的海事管理机构申请初次适任考试，无需重新培训。

2. 毕业时间超过 5 年：需要有 1 年的海上服务资历后，可凭毕业证书向具有相应考试权限的海事管理机构按照初次适任考试的相关要求申请适任考试。

3. 在校期间已申请的初次适任考试及相关补考未全部通过或成绩失效，且毕业时间在 5 年内未再次申请：在具有不少于 12 个月相应的支持级海上服务资历后，可凭毕业证书向具有相应考试权限的海事管理机构按照初次适任考试的相关要求申请适任考试。该适任考试未通过或成绩失效的，再次申请适任考试需重新参加相应的岗位适任培训。