海员健康证有效期为一年主要有以下几方面原因：
年龄因素：如果海员年龄小于 18 周岁，身体仍处于发育阶段，身体状况可能会有较大变化，所以健康证的有效期不超过 1 年，以确保未成年人上船工作时身体状况始终符合岗位要求。
健康风险因素：对于年满 18 周岁的海员，如果在体检时发现某些健康指标不太理想，存在可能影响其在船上工作的健康问题，如听力不达标、患有结石、转氨酶过高等，医生可能会根据具体情况判断该海员的健康风险相对较高，给出 1 年有效期的健康证。这样可以促使海员更加关注自己的健康状况，及时进行复查和治疗，同时也能保证船上工作的安全性。
工作环境因素：海上工作环境特殊，长期处于相对封闭、潮湿、颠簸的环境中，工作强度大，作息不规律，对海员的身体和心理健康都有一定的挑战。较短的健康证有效期可以确保海员的身体状况始终适合这种高强度、高压力的工作环境。
法规要求不同：除了海事局要求的有效期不超 2 年的健康证外，还有出入境管理局要求的国际旅行健康证，有效期为 1 年，适用于外贸船员。这种健康证主要是基于国际卫生检疫的要求，确保船员在国际航行中不会传播疾病，保障公共卫生安全。跑外的船员既需要 2 年有效期的海事局健康证，也需要出入境管理局的 1 年有效期健康证。
