海船船员适任证书过期后的处理方式及能否重新有效，要根据过期的时间长短来定。具体情况如下：
过期 3 个月以内：
可以在适任证书有效期届满后 3 个月内向有相应管理权限的海事管理机构申请适任证书再有效。
过期 3 个月及以上 5 年以下：
应当参加模拟器培训和知识更新培训，并通过相应的抽查项目的评估，成绩合格后才可使证书再有效。
过期 5 年及以上 10 年以下：
需要参加模拟器培训和知识更新培训，并通过相应的抽查科目的理论考试和项目的评估，且在适任证书记载的相应航区、等级范围内按照《船上见习记录簿》规定完成不少于 3 个月的船上见习，之后才能重新申请适任证书。
过期 10 年以上：
应当参加模拟器培训和知识更新培训，通过相应的抽查科目的理论考试和项目的评估，并在适任证书记载的相应航区、等级范围内按照《船上见习记录簿》规定完成不少于 3 个月的船上见习。
