网上申请船舶最低安全配员证书，一般步骤如下：
注册并登录相关平台：
打开中华人民共和国海事局官网（https://www.msa.gov.cn），点击 “一网通办” 平台。如果之前已在海事管理机构采集过信息，原始账号为身份证号码，密码为手机后八位；若未曾采集信息则需选择个人或企业注册（如果是个人所有的船舶，注册个人账号；如果是公司所有的船舶，注册企业账号），按照提示填写资料完成账号注册。原中国海事综合服务平台账号、密码跟海事 “一网通办” 平台账号通用，可直接用原账号登录。
申请权限开通：
账号注册成功后，进入海事 “一网通办” 平台主界面。选择 “用户注册审批管理”，点击 “用户注册（政务）”，选择 “注册提交机构” 为相应的海事机构，勾选 “角色名称”，申请人选 “1. 外网业务申请角色”、“2. 无线电外网业务申请角色”，点击 “提交审核”，等待海事管理机构审核通过。
填写申请信息：
待海事管理机构授权通过后，重新选择 “最低配员证书核发” 业务，点击 “在线办理”，进入相关系统。
选择 “新增内河最低配员申请”（若是海船申请，可能有相应的海船申请选项），填写船舶识别号，点击空白处，船舶基础信息会自动出现。
选择本次申请的相应形式，如 “签发”（若为换证等其他情况，选择对应的选项）；符合标准选择 “内河船舶最低安全配员一般标准”（具体标准需根据船舶的实际情况和相关规定选择）。
对附加规定或特别要求说明等进行勾选确认；确认申请信息真实处打√。
填写完成后点击 “保存”。
上传相关材料：
保存成功后，点击 “申请表打印” 按钮，打印出船舶最低安全配员证书申请书，在申请书下方手动填写申请人（船舶所有人）和日期，然后扫描或拍照该申请表备用。
点击 “扫描件上传”，上传船舶最低安全配员申请书以及其他相关证明文件的扫描件（不同地区可能要求的具体材料有差异，但一般包括船舶所有权证书、船舶国籍证书等）。
提交申请：
上传成功后，仔细检查申请信息和上传的材料，确认无误后点击 “提交” 按钮。
跟踪申请进度：
提交申请后，可以登录系统自主查询办理环节，了解申请的审批进度。
领取证书：
申请审核通过后，根据系统提示或当地海事管理机构的要求领取船舶最低安全配员证书。有些地区可以在系统中用 A4 纸自行打印最低安全配员证书，无需盖章；有些地区可能需要到指定地点领取纸质证书。
