马士基航运在中国的内河航线合作港口目前主要有淮安港。

2024 年 8 月 8 日，马士基航运淮安港外贸全程单（cca）业务正式启航，这使得淮安港成为马士基航运在全国内河首个开通 cca 业务的港口。淮安港纳入马士基航运全球网络体系后，淮安及周边外贸企业的货物可以使用马士基的集装箱从淮安港属地报关、出运，通过马士基的全球航线 “通江达海” 至世界各地。

此外，历史上如皋港也曾有过与马士基航运的合作。2019 年，马士基入驻如皋港，为如皋港的对外贸易交流打开了新通道。不过关于其后续在内河航线合作方面的具体发展情况，可能需要进一步的信息来确认。