灵活性
航运仲裁的程序更加灵活。当事人可以根据自己的意愿选择仲裁机构、仲裁规则、仲裁地点和仲裁语言等。而诉讼程序则要严格遵循法院地的诉讼程序法，当事人的自主选择权相对较小。例如，在仲裁中，当事人可以约定简化证据提交程序，而在诉讼中，证据的提交和质证通常要按照法定的程序进行。
保密性
仲裁过程和裁决结果一般是保密的，这对于保护商业秘密和商业信誉非常重要。而诉讼一般是公开进行的，除了涉及国家秘密、个人隐私等法定不公开审理的情况外，案件的审理过程和判决结果都会向社会公开。
效率
仲裁在程序上通常比诉讼更高效。仲裁机构可以根据案件的复杂程度和当事人的要求，灵活安排仲裁程序，避免了诉讼中可能出现的复杂的上诉程序和长时间的排期等待。例如，在一些简单的航运纠纷中，仲裁可以在较短的时间内作出裁决，而诉讼可能需要较长时间才能审结。
航运仲裁员一般都是航运领域和法律领域的专家，能够凭借其专业知识对复杂的航运纠纷进行准确的审理。而法院的法官虽然也具有法律专业知识，但可能在航运业务细节方面不如仲裁员熟悉。例如，在船舶技术纠纷中，仲裁员的航运技术知识可以更好地帮助其理解案件事实，作出合理的裁决。
仲裁裁决的执行主要依赖于当事人的自觉履行和相关国家之间的司法协助。如果一方不履行仲裁裁决，另一方需要向有管辖权的法院申请强制执行。而法院判决在本国司法体系内具有更强的强制执行力，法院可以直接采取强制执行措施。但是，在国际范围内，仲裁裁决和法院判决的执行都需要考虑不同国家之间的司法协助和相关国际公约的规定。
如果当事人注重保密性、灵活性和专业性，并且希望能够快速解决纠纷，航运仲裁可能是一个较好的选择。但如果当事人对裁决的强制执行力有较高的要求，并且不介意公开审理过程，诉讼也可以作为一种解决航运纠纷的方式。
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