正规电子海图的水深数据通常较为准确，其来源多为官方海事测绘、卫星遥感结合实地勘测。但因海洋环境动态变化，可能存在细微偏差。校准方面，一是定期比对官方最新的水文报告，若发现局部水深数据差异，及时反馈给电子海图供应商；二是在靠港时，利用码头已知的水深基准点，对比设备显示水深，如有误差，按设备校准流程调整参数；航行中，若经过高精度测绘的航道，也可参照航道部门公布的数据校准，确保航行避开浅滩等危险。
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