船用燃油从开采到使用流程复杂。开采环节，陆上或海上石油钻井平台从地下或海底抽取原油，经管道或油轮运输至炼油厂。在炼油厂，原油通过蒸馏、裂解等工艺分离出不同馏分，重油作为残渣产品，轻油则是较纯的馏分。随后，根据船用标准，对燃油进行调配、添加添加剂等处理，如为满足环保要求，降低硫含量，添加脱硫剂或进行加氢处理。成品燃油通过油轮、驳船等运输至港口油库，船舶靠港时，依据自身需求，从油库抽取燃油注入燃油舱。在船舶上，燃油经过加热（重油）、泵送。在船舶上，燃油经过加热（重油）、泵送、过滤等环节进入发动机参与燃烧，为船舶提供动力，推动螺旋桨旋转，使船舶航行在海洋之上。燃烧产生的废气则通过船舶的排气系统排放到大气中，不过如今为了符合环保要求，很多船舶还配备了尾气处理装置，对排放的废气进行净化处理，比如通过安装脱硫装置减少硫氧化物排放，通过安装颗粒物捕集器降低颗粒物排放等，从而完成整个从开采到使用并兼顾环保要求的循环过程。
