初步判断事故类型和严重程度：船长在发现或得知船舶发生事故后，首先要迅速对事故类型进行判断，例如是碰撞、搁浅、火灾、爆炸、进水还是人员落水等。同时，要评估事故的严重程度，包括船舶的受损程度、人员伤亡情况、对航行安全的影响等。例如，在发生碰撞事故后，船长需要立即了解碰撞位置、船舶破损范围和程度，判断船舶是否还能保持漂浮和航行能力。

发出遇险报警：如果事故严重威胁船舶安全和人员生命，船长应立即通过全球海上遇险与安全系统（GMDSS）发出遇险报警。报警内容包括船舶的识别码、位置（经纬度）、事故类型等关键信息。同时，利用船上的甚高频（VHF）电台向附近船舶通报事故情况，请求援助。例如，在船舶火灾无法控制时，船长要紧急广播船名、呼号、遇险位置和火灾情况，以便周围船舶能够快速定位并提供帮助。

启动应急计划：船长要启动船舶的应急计划，明确各部门和船员在应急情况下的职责。根据事故类型，指挥相关船员按照既定的应急程序开展工作。例如，在船舶进水事故中，轮机长带领轮机部人员负责控制机舱内的进水情况，检查和关闭相关阀门；大副带领甲板部人员检查和堵塞其他舱室的漏洞，组织排水工作。

人员集结与清点：安排船员通过船上的广播系统或其他通讯设备进行紧急集合，确保所有船员都能知晓事故并到达指定位置。在集合后，要尽快清点人数，确定是否有人员失踪。如果发现人员失踪，要立即组织搜寻。

火灾和爆炸事故处理：在火灾或爆炸事故中，船长指挥船员按照消防应急程序进行灭火。首先要切断火灾现场的电源和燃油供应，防止火势蔓延。组织船员使用船上的消防设备，如灭火器、消防水带等进行灭火。同时，要注意防止爆炸危险，避免在有易燃易爆气体积聚的区域使用可能产生火花的设备。例如，在油舱附近发生火灾时，要特别小心，避免引起油舱爆炸。

碰撞和搁浅事故处理：对于碰撞事故，船长要判断船舶是否还具备航行能力。如果船舶仍可航行，要谨慎操纵船舶，避免二次碰撞，选择安全的位置停靠或继续航行到附近港口。在搁浅事故中，要稳定船舶状态，防止船舶进一步受损。组织船员测量船舶周围的水深，检查船底破损情况，尝试通过卸载货物、调整压载水等方式使船舶脱浅。

进水事故处理：在船舶进水事故中，要迅速确定进水位置和进水速度。指挥船员关闭水密门、舱口盖等防水设施，阻止海水蔓延到其他舱室。启动船上的排水设备，如污水泵、消防泵等进行排水。同时，要组织船员对进水舱室进行堵漏，如使用堵漏器材、木塞等堵住漏洞。

乘客安全保障：如果船上有乘客，船长要确保乘客的安全。通过广播系统向乘客通报事故情况，安抚乘客情绪，组织船员引导乘客到安全区域，如救生艇集合点或安全舱室。为乘客发放救生衣，讲解救生设备的使用方法，确保乘客在必要时能够正确使用。

货物安全处理：对于载货船舶，船长要考虑货物的安全。在事故可能导致货物受损或移位的情况下，指挥船员采取措施保护货物。例如，在船舶发生倾斜时，调整货物的位置以恢复船舶的平衡；在火灾事故中，对于易燃、易爆货物，要采取隔离和灭火措施，防止货物燃烧或爆炸。

与救援船舶沟通：在发出求救信号后，船长要与前来救援的船舶保持密切联系。向救援船舶提供本船的详细情况，如船舶损坏程度、人员伤亡情况、所需的救援物资等。协调救援船舶的救援行动，例如安排救援船舶进行人员救助、拖带本船等。

与海岸电台和相关部门联系：船长要通过卫星通信等设备与海岸电台、港口当局、海事救援中心等相关部门联系。报告事故的最新进展情况，接受他们的指挥和建议。按照要求提供各种信息，如船舶的位置、航向、航速、事故处理措施等，以便相关部门能够更好地组织救援和后续处理工作。

记录事故情况：在应急处理过程中，船长要安排专人（如大副或三副）记录事故的详细情况，包括事故发生的时间、地点、原因、经过、采取的应急措施、人员伤亡和货物损失情况等。这些记录对于事故调查和保险理赔等后续工作非常重要。

配合调查和后续处理：在船舶安全得到保障、事故得到初步控制后，船长要积极配合相关部门的事故调查。提供真实、准确的信息，协助调查人员了解事故的全貌。同时，要组织船员对船舶进行检查和修复，评估船舶是否还能继续航行，或者需要拖带到港口进行大规模维修。对于货物损失，要按照相关规定和保险条款进行处理。