不同港口的海运拼箱费用构成主要在以下几个方面存在差异：
收费标准：不同港口由于地理位置、经济发展水平、港口设施等因素不同，基本运费的收费标准存在差异。例如，上海港、深圳港等大型枢纽港口，航线密集、运输量大，基本运费相对较为稳定且可能相对较低；而一些小型港口或偏远港口，因运输成本相对较高，基本运费可能会偏高36.
计费方式：多数港口按照货物的体积或重量来计算基本运费，取两者中收费较高者，即 “W/M” 原则，但也有部分港口可能会有特殊的计费方式或对某些货物有额外的计费规定 。如对于轻泡货物，一些港口可能会更严格地按照体积计费，而另一些港口可能会综合考虑货物的价值等因素46.
常见附加费种类：常见的燃油附加费、货币贬值附加费、港口拥挤附加费等，在不同港口的收取情况有所不同。比如，对于燃油附加费，受国际油价波动影响，油价上涨时，各港口都会收取，但具体的征收标准和调整频率会因港口而异。一些繁忙的大型港口，如新加坡港、鹿特丹港等，由于船舶进出频繁，港口拥堵情况相对严重，港口拥挤附加费的收取可能会更为常见且费用相对较高234.
特殊附加费：不同港口还可能会根据自身特点收取一些特殊的附加费。例如，某些港口为了加强港口安全管理，会收取安全附加费；对于通过运河的货物，如苏伊士运河、巴拿马运河等，还需支付运河附加费等135.
码头操作费：不同港口的码头操作费差异较大。一般来说，大型港口的码头设施先进、自动化程度高，操作效率相对较高，码头操作费可能相对较低；而一些小型港口的设备相对简陋，人工操作较多，码头操作费可能会偏高134.
拆箱费：目的港的拆箱费也因港口而异。这与港口的劳动力成本、拆箱设备的使用以及当地的市场行情等因素有关。在发达国家的港口，劳动力成本较高，拆箱费可能会比发展中国家的港口要高134.
仓储费：如果货物在目的港需要仓储一段时间，仓储费的收取标准会因港口的仓储条件和市场需求不同而有所不同。一些物流发达的港口，仓储设施完善，竞争较为充分，仓储费可能相对较为合理；而对于仓储资源紧张的港口，仓储费则可能会较高36.
清关手续费：不同国家和港口的清关政策和手续复杂程度不同，清关手续费也会有所差异。例如，一些发达国家的港口，对进口货物的检验检疫要求严格，清关手续繁琐，清关手续费相对较高；而在一些自由贸易港或经济特区的港口，清关政策较为优惠，清关手续费可能会相对较低23.
货代代理费：货代在不同港口的收费标准和服务内容可能不同。在一些港口，货代市场竞争激烈，代理费相对较低，但服务质量可能参差不齐；而在另一些港口，货代资源相对稀缺，代理费可能会偏高，但服务可能会更专业、更全面17.
内陆运输费：如果货物需要从港口运输到内陆的目的地，内陆运输费也是海运拼箱费用的一部分。不同港口到内陆的距离、运输方式以及当地的运输市场情况都会影响内陆运输费的高低。例如，靠近经济发达地区的港口，内陆运输网络发达，运输成本相对较低；而对于一些偏远港口，内陆运输距离远，运输条件差，内陆运输费可能会很高 。
