海洋地形地貌：海洋中的暗礁、浅滩、岛屿等地理障碍对航线选择影响显著。例如，船舶需要避开布满暗礁的海域，如南海的部分岛礁区，因为这些区域容易导致船舶触礁事故。在有众多岛屿分布的海域，如地中海的爱琴海区域，航线需要精心规划，以确保船舶安全地穿梭于岛屿之间，避免搁浅或碰撞。

海峡与运河：海峡和运河是海运航线的关键节点。它们的地理位置和通航条件直接影响航线选择。例如，苏伊士运河连接地中海和红海，大大缩短了欧洲与亚洲之间的航程，是许多欧亚航线的必经之路。然而，运河的深度、宽度限制以及收费标准等因素也需要考虑。同样，巴拿马运河对于连接大西洋和太平洋的贸易航线至关重要，其通航能力（如能通过的船舶最大尺寸）和费用情况会使航运公司在航线规划时权衡利弊。

气候类型和天气变化：不同海域的气候差异很大，这对航线选择有重要影响。例如，在北太平洋和北大西洋的高纬度地区，冬季经常会出现狂风、暴雪和巨浪等恶劣天气，船舶在这些季节可能会避开这些区域，选择更靠南的航线。而在赤道附近，虽然天气相对稳定，但也有降雨量大、热带风暴等情况需要考虑。

海况特点：海浪、涌浪和洋流的情况也是重要因素。强洋流可以帮助船舶加快航速，节省燃料，但也可能使船舶偏离航线，增加航行风险。例如，北大西洋暖流对欧洲西部沿岸的航运有一定的助力，但如果船舶不能正确应对，可能会被洋流带偏。而在一些海域，如好望角附近，经常出现巨浪，被称为 “咆哮西风带”，这使得船舶在选择是否经过该区域时需要谨慎权衡。

货物种类和性质：不同种类的货物对航线有不同的要求。对于易腐货物，如生鲜农产品、鲜花等，通常会选择运输时间短、冷藏条件好的航线。这些货物可能会优先选择直航或者中转次数少的航线，以保证货物的新鲜度。而对于一些对时间不敏感的大宗商品，如矿石、煤炭等，航线选择可能更侧重于降低运输成本，对运输时间的要求相对较低。

货物的目的地和市场需求：货物的最终目的地以及目的地市场的需求情况也会影响航线选择。如果目的地市场对货物的需求紧急，那么会选择能最快送达的航线。例如，当欧洲市场急需某一批电子零部件时，从亚洲出发的船舶可能会选择速度相对较快的跨洋直航航线，而不是经过多个港口中转的航线。

海盗活动区域：海盗活动猖獗的海域会使船舶尽量避开。例如，索马里海域曾是全球海盗活动的重灾区，许多船舶为了安全会选择绕过这一区域，或者加入护航编队。即使在一些海盗活动相对较少的海域，如东南亚部分海域，航运公司也会关注当地的治安情况和海盗活动趋势，谨慎选择航线。

地缘政治局势：国家之间的紧张关系、军事冲突、海上封锁等地缘政治因素会对航线安全构成威胁。例如，在中东地区发生军事冲突时，周边海域的航线可能会受到影响，船舶需要考虑绕开冲突区域，或者等待局势稳定后再通过。

港口费用和服务质量：不同港口的收费标准差异较大，包括码头费、装卸费、引航费等。航运公司在选择航线时会考虑港口的费用，尽量选择收费合理的港口。同时，港口的服务质量也很重要，高效的港口可以减少船舶在港时间，提高船舶的周转效率，降低运营成本。例如，一些现代化的大型港口，如上海洋山港、新加坡港等，其高效的装卸设备和物流服务可以吸引更多的船舶停靠。

运输成本和经济效益：航线的运输成本包括燃料成本、船舶折旧、船员薪酬等多个方面。较短的航线通常可以节省燃料成本，但也需要考虑其他因素，如通过运河的费用、港口停靠成本等。航运公司会综合考虑各种成本因素，选择经济效益最高的航线。例如，通过比较不同航线的总成本，包括航程中的燃料消耗、可能的运河通行费以及港口装卸成本等，来确定最适合的航线。